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SNP,单核苷酸多态性( Single Nucleotide Polymorphism,SNP )
单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是基因组学中的一种基本变异形式,涉及到基因序列中单个核苷酸位置的差异。SNP作为分子标记,具有极高的分辨率和广泛分布性,遍布整个基因组,并且遗传稳定性较高,使之成为研究遗传多样性和复杂疾病关联的理想选择。据估计,在人类基因组中,每千个碱基对就可能存在一个SNP,预示着总SNP数量可高达三百万以上。这些变异在非编码区域比编码区域更为常见,并且大多位于蛋白质编码基因的非功能性部分。SNP通常体现为两种等位基因形式,最常见的变化类型是从一种嘧啶替换为另一种(转换),或嘌呤之间的互换,转换事件大约是颠换的两倍。值得注意的是,SNP在富含CG序列的区域尤为突出,其中胞嘧啶(C)经甲基化后易转化为胸腺嘧啶(T)。
为满足对SNP进行高效、精准分析的需求,现有的SNP技术服务平台涵盖了多种先进方法,包括但不限于:
DNA测序分型:直接读取目标SNP位点的碱基序列。
Taqman探针分型:利用特异荧光探针进行实时PCR分析。
Multiplex SNaPshot分型:一次反应中同时检测多个SNP位点。
飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)分型:基于质荷比差异快速区分SNP。
LDR(链置换反应)分型:通过高温连接酶反应特异性识别SNP。
HRM(高分辨率熔解曲线)分型:利用DNA熔解特性区分碱基序列差异。
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